概要
菌種を識別するために広く用いられている16s/ITS/28(26)S rRNAの配列を解析するため、DNA抽出、PCR、シーケンス、アセンブル、BLASTまでの包括的なサービスを提供致します。
特徴
- バクテリア、カビ、酵母が対象
- 国内最安でDNA抽出からBLASTまで行います。
- 菌株到着後、1~5営業日で結果報告。
* 午後に到着した菌株については、翌日受付の扱いになります。
* 繁忙期等にはご注文状況によって納期が前後する場合がございます。
1回のご注文で解析するサンプルが20菌株を超える場合は事前にご相談下さい。
* 病原性・感染性を有する可能性のある菌株の解析はお受けできません。
抽出済みのgDNAをお送りください。
- ID発行から結果報告までマクロジェン・ジャパンのLIMS(Laboratory InformationManagement System)を使用した情報管理
- バクテリア16Sは、1,300bp以上を保証
マクロジェン・ジャパンが提供する系統樹は、あくまでも簡易的なものになります。
論文投稿に使用できるものでは御座いません。予めご了承ください。
プライマーセット
- 下図に示したプライマーセットのうち、ご希望のセットで解析いたします。また1セットだけでなく、2セットでの解析も可能です(別途料金が発生いたします)。
- 解析終了後、別のプライマーセットでの追加解析をご希望の場合はウェブオーダーより新規ご注文登録していただき、付記事項欄に「【初回ご注文番号】の追加解析分」とご記入ください。
- 下図に無い、カスタムプライマーでの解析をご希望の場合はご相談ください。
解析結果
解析が終了次第、以下のデータをダウンロードしていただくことができます。
- シーケンス結果(Raw data)
ab1, txt, pdf, phd, scf ファイルの5種類がございます。
- Contig配列
シーケンス結果から作成されたContigの情報です。
- Blast解析結果
Contig配列をクエリにしてBlast N解析をした結果です。
- Report
菌株ごとの解析結果について、まとめたレポートです。
データのダウンロードは結果通知メールのリンクまたはマイページでお願いします。
* 結果は1か月以内にダウンロードをお願いいたします。納品から1か月経過しますとデータを削除いたします。
* サンプルの保管期間は納品日より10日間です。保管期間を経過したサンプルはマクロジェン・ジャパンにて滅菌処理いたします。
* 当サービスではマクロジェン・ジャパンスタッフによる菌種同定は致しません。解析結果をご確認の上、お客様ご自身にてご判断ください。
菌株の準備
菌株は純粋培養されたシャーレまたはグリセロールストックでお送りください。
* 病原性を有する可能性のある菌株の場合、抽出はお受けできません。抽出済DNAの状態でお送りください。
シャーレでお送りいただく場合
・コロニーが目視で確認できる状態でお送りください。
・パラフィルムなどで封をお願いします。
・冷蔵便でお送りください。
グリセロールストックでお送りいただく場合
・遠心時にペレットが確認できる程度の菌量を、1mLほどお送りください。
・冷凍便でお送りください。