～イルミナ社の次世代シーケンサーを用いたオーダーメイドな解析～
データ量を増やしたい、ランだけお願いしたいなど、お客様の要望に応じてアレンジいたします。
お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。
| 作業内容 | サンプル数 | ご提供サンプル | 価格（税抜） |
|---|---|---|---|
| DNA抽出から | 8サンプルまで | 検体 | ￥40,000 |
| 9～16サンプル | ￥60,000 | ||
| PCRから | 8サンプルまで | 抽出DNA | ￥20,000 |
| 9～16サンプル | ￥30,000 |
| 作業内容 | 価格（税抜） |
|---|---|
| RNA抽出（＊1） | ￥15,000 / サンプル |
| リボソーム除去（illumina） | ￥30,000 / サンプル |
| ライブラリ調製（illumina） | ￥25,000 / サンプル |
＊1 ファスマック社でノウハウのないものについてはお断りさせていただく場合があります。
illuminaシーケンサーによるラン| 項目 | 価格（税抜） | |
|---|---|---|
| QC（quality control）作業 | 送付サンプルの濃度・品質チェック[必須] | 16サンプルまで￥30,000 |
| 共有解析 2×250 bp | 他のお客様のサンプルと相乗りでランを実施（＊2） | ￥115,000 |
| 共有解析 2×300 bp | ￥150,000 | |
| 専有解析 2×250 bp | 一人のお客様のサンプルのみでランを実施 | ￥330,000 |
| 専有解析 2×300 bp | ￥450,000 | |
| 項目 | 価格（税抜） | |
|---|---|---|
| QC（quality control）作業 | 送付サンプルの濃度・品質チェック[必須] | 16サンプルまで￥30,000 |
| 共有解析 2×300 bp | 他のお客様のサンプルと相乗りでランを実施（＊2） | ￥100,000 |
| 専有解析 2×300 bp | 一人のお客様のサンプルのみでランを実施 | ￥400,000 |
＊2 サンプル投入量10% 以上を保証いたします。ただし、データサイズやリード数の保証は行っておりません。 詳細は以下の「解析の結果得られるデータ量について」をご参照ください。
＜解析の結果得られるデータ量について＞
イルミナ社のカタログスペック値では1ランで得られるデータ量は以下の通りとなっております（ペアエンドリード）
MiSeqの場合（詳細はこちら）
・2×250 bp試薬での解析 7.5~8.5 Gb（2,400万~3,000万リード）
・2×300 bp試薬での解析 13.2~15 Gb（4,400万~5,000万リード）
MiSeq i100 Plusの場合（詳細はこちら）
・2×300 bp試薬での解析 13.2~15 Gb（4,400万~5,000万リード）
illuminaシーケンサーの解析原理であるSBS（Sequencing By Synthesis）法では解析する配列によって得られるデータ量が変化します。 一般的にはアンプリコン（PCR産物）についてはデータ量が少なくなる傾向にあります。 また、解析時には必ずコントロールとして PhiX ライブラリーをサンプルに応じて10～30 % 程度添加します。 このような理由から、ファスマック社はデータ量の保証は行っておりません。
データ解析
データ解析作業の一例は以下の通りです。 その他、パッケージサービスで選択可能な解析オプションもご指定いただけます。
外部取得データ（お手持ちのfastqファイル）を使用したデータ解析にもご利用可能ですので、詳しくはお問い合わせください。
| 作業内容 | 価格（税抜） |
|---|---|
| アセンブルとコンティグ作成 | ￥40,000/サンプル |
| QIIME等でのデータ解析 | ￥1,000/サンプル |
【サンプルおよびデータの保管期限】
サンプルおよびデータの保管期限は、パッケージサービスと同様です。
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