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セツロテック / セツロテック ID: J02297

NGS解析 (アンプリコンのNGS解析) ID: J02297

サービスについて

サービス内容

PCR増幅したDNA断片をIllumina NGSで解析します。CRISPR-CasやshRNAを利用したスクリーニングで、crRNA配列やshRNA配列の頻度解析が可能です。
また、細菌16S rRNA配列や真核生物18S rRNA配列の解析で生物種解析ができます。その他、ゲノム編集効率や特定領域の多様性解析など、ショートリードディープシークエンサーを用いることで幅広い解析が可能です。

特長

  • 試料をお送りいただくだけでアンプリコン解析が可能。1st PCR産物や、DNA抽出物をお送りいただくこともできます。
  • CRISPRやshRNAなどによる大規模スクリーニングでの配列決定等に
  • ゲノム編集効率確認や、多様性解析などに
  • 16S rRNAや18S rRNA配列解析による種同定に
  • ペアエンド解析で最大600bp (300bp x2)
  • 1サンプルにつき3-5万リードペア程度
  • まとめて解析することでよりリーズナブルに

ご提供いただくサンプル/情報

試料から
・培養細胞 10^5細胞
(*BSL2まで対応。感染細胞である旨はお知らせください)
・組織断片 100mg以上
・プライマー配列(既に決まっている場合)
*土壌・糞便・腸管内容物等の場合、事前にご相談ください。
*感染性のあるサンプルや、その他弊社が受け入れ困難と判断した場合、お断りすることがあります。

抽出したDNA
・0.5 ng/uL以上のDNA溶液で、液量20uL以上 が望ましい。
・目的の配列情報
・プライマー配列(既に決まっている場合)

1st PCR産物
・精製前の1st PCR産物(15uL以上)
  : 目的の増幅産物があることをご確認ください。(電気泳動図等をご提供ください。)
・増幅断片のサイズ
・1st PCRに用いたプライマー配列

納品物

・報告書
・fastqファイル
(1サンプルにつき3-5万リードペア程度)

ご注文に関して

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
NGS解析 (アンプリコンのNGS解析) お問い合わせ ・試料から:6週間
・抽出したDNA:5週間
・1st PCR産物:5週間

関連サイト