概要
ウシ・ブタ・鶏の形質評価、親子鑑定、品種推定が可能なSNPを搭載したアレイを用いた受託サービスです。
繁殖集団の遺伝情報の管理や、生産性向上・ゲノム育種等にお役立てください。
特長
- ウシ、ブタ、鶏のSNPタイピング受託サービス
ゲノムワイドに数万SNPを対象にしたものから、選別した96SNPを対象にしたサービスをご用意しています。
解析に使用するプラットフォームはIllumina社のGGPビーズチップやクラボウのDNAマイクロアレイを利用します。
- ご用意いただくのはゲノムDNAのみ
個体から調製したゲノムDNAをクラボウにお送りいただければ、実験・解析を行ったSNPタイピングデータをお届けいたします。
サンプル試料からのゲノムDNA抽出についても、ご相談いただけます。
- 納品データ
サンプル毎に、SNPタイピングデータをお届けします。乳牛GGPチップについては、オプションで評価レポートを作成・納品することも可能です。
Illuminaビーズチップ
- Illumina社のビーズチップを用いた解析サービスです。
ウシ・ブタを代表に、各種動物種に対するゲノムワイドなSNPタイピング結果をお届けします。
- ウシチップ
搭載SNPは以下の以下の病気や形質に関するマーカーも搭載しています。
Beta Casein A/B、Beta Lactoglobulin、Black/Red Coat Color（346, 358, 373）、Chondrodysplasia Citrullinemia、DUMPS、Factor XI、Holstein haplotypes impacting fertility、Kappa Casein I、Silver Color Dilutor、Y chromosome infertility
- ブタチップ
これらのSNPには以下の病気や形質に関するマーカーを搭載しています。
A dystrophin defect that is associated with porcine stress syndrome、Commonly utilized USDA parentage/identity SNPs、Porcine stress syndrome（HAL）、Rendement napole（RN）
Axiome® Chicken Array
Affymetrix社のAxiom
® Genome-Wide Chicken Genotyping Arrayを用いた受託サービスです。
白色卵系レイヤー、褐色卵系レイヤー、ブロイラー、非商業用・非近交系の野生種の遺伝的バリアントの検出が可能です。
ブタ遺伝子型受託解析サービス
DNAマイクロアレイを用いた、ブタ遺伝子型受託解析サービスです。（
fig.1）
DNAマイクロアレイには、豚形質（肉質・繁殖性・免疫能等）の判定用SNP、および父子鑑定・品種判別用として染色体を広範囲にカバーしたSNPを搭載しています。
お預かりしたサンプルに対し、これらの96種のSNPに対して解析し、タイピングデータをお届けします。
用途
- 育種マーカーの探索
- 父子鑑定
- 種牛（豚）や系統の育種・改良
- 品種鑑定（偽装防止）（fig.2）
- SNP情報による個体の流通管理・トレーサビリティ
製品リスト
| 生物種 |
製品名 |
解析プラットフォーム |
搭載SNP |
| ウシ |
GGP Bovine 100K解析サービス |
Illuminaビーズチップ |
100K |
| ブタ |
GGP Porcine 50K解析サービス |
Illuminaビーズチップ |
50K |
| ニワトリ |
Affymetrix Axiom Chicken受託解析サービス |
Axiom Array |
580K |
| ブタ |
ブタ遺伝子型受託解析サービス |
DNAマイクロアレイ |
96種類
・形質判定用SNP 19SNP
・父子鑑定、品質判別用SNP |
＊ その他の動物種・アレイについてもご相談ください。
サービスの流れ
お客様からお預かりしたゲノムDNAを用いて、アレイ解析を行い、SNPタイピングデータをお届けします。
ご要望に応じて、SNPタイピングデータから、評価レポートの作成まで行います。（オプション、対応できないサービスもあります）
- サンプルお預かり
- （オプション：ゲノムDNAの抽出）
- ご指定いただいたプラットフォームを用いて解析を実施
- SNPタイピング結果の出力
- （オプション：評価レポートの作成）
- データ納品
