マクロジェン・ジャパン / コスモ・バイオ ID: J00521

トランスクリプトームシーケンシング ID: J00521

サービスについて

概要(fig.1

  • トランスクリプトームシーケンシングでは、RNA 解析によりサンプル間の 発現量の差 (Expression profile) を見ることができ、リファレンスデー タベースがない種でも新規トランスクリプトーム解析を行えます。
  • 21~23個のヌクレオチドで構成されている非翻訳領域の small RNA (small non-coding RNA) が siRNA や miRNA として作用するメカニ ズムはよく知られています。

データ解析(*)(fig.2

  • Transcriptome data analysis
    ・Standard data analysis
     - de novo Assembly / Alignment and Statistics
     - Gene expression profile
     - Differentially Expressed Genes(DEGs)
     - SNPs and Indel calling by mapping to reference genome
    ・Advanced data analysis
     - Gene Annotations / Gene Set Analysis
     - Comparative analysis
     - Customized analysis

  • Small RNA data analysis
    ・Small RNA data Analysis
     - Expression Profiles, Novel smRNA, Differentially Expressed miRNA
     - Target Prediction of Known miRNA
     - Gene Set Analysis
     - Comparative analysis

 * Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 RNA-seq small RNA-seq
使用機種 NovaSeq 6000 or NovaSeq X plus HiSeq2500
対象生物 ヒト、マウス、ラット等 ヒト、マウス、ラット等
データ量 4 Gb or 6Gb (リード数:4,000 万) 1 レーン使用:約 8 Gb
リード長 100 bp or 150bp 50 bp
シーケンス方法 Paired End Single End
必要サンプル量 Total RNA 1 µg 以上(mRNA Library Prep)
Total RNA 0.5 µg 以上(Total RNA Library Prep)
Total RNA 3 µg 以上
価格(税抜)
  • ライブラリ作製およびシーケンス
    TruSeq®stranded mRNA Library Prep. Kit
    真核生物用(PolyAキャプチャー対応でのmRNA-Seq仕様)
    ¥40,000/サンプル

    TruSeq® stranded Total RNA Library Prep. Kit with RiboZero Plus kit
    ヒト・マウスなどの哺乳類、バクテリアなどの微生物解析用
    ¥51,000/サンプル
  • データ解析(Human,MouseのDEG解析)
    ¥16,000/サンプル(*1)
  • ライブラリー作製:¥51,000
    (TruSeq Small RNA Library Prep Kit使用)
    1 レーン:¥215,000
  • データ解析:¥49,000
納期(QC合格後) 約 4~6 週間 約 8 週間(データ解析まで)
納品物
  1. シーケンシング結果(fastq)
  2. サンプル間の発現レベル比較結果
  1. シーケンシング結果(fastq)
  2. サンプル間の発現レベル比較結果

*1 Human、Mouseサンプルで5比較以上は追加費用が必要となります。

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