受託オンラインCommissioned Research Online和研薬株式会社 和研薬株式会社

カテゴリー

お問い合わせ

マクロジェン・ジャパン / コスモ・バイオ ID: J00520

エクソーム / ターゲットシーケンシング ID: J00520

印刷

エキソンを効率的にキャプチャーし、遺伝子翻訳領域およびUTRを選択的にシーケンシング

カテゴリ

サービスについて

概要（fig.1）

Human Exome Sequencingでは、エキソンを効率的にキャプチャーし、遺伝子翻訳領域およびUTRを選択的にシーケンシングします。（一部動物も可。）

Targeted Sequencingでは、目的の領域をキャプチャーできるCustomized Kitを製作してシーケンシングします。

fig.1 Capture of Target Reglons

プラットフォーム / キャプチャーキット

HiSeq / MiSeq system（Single, Paired-end）
Capture Kit
・llumina Nextera
・Agilent SureSelect
・Nimblegen SeqCap EZ

データ解析（fig.2）

Exome / Target data analysis
・Standard data analysis
　- Mapping to the current plant reference genome
　- Analysis of mapping statistics
　- SNPs and Indel calling
　- Variant annotation
・Advanced data analysis
　- Comparative analysis
　- Disease analysis

fig.2 Technology pipeline for Exome/Target Sequencing

　＊ Data Analysis may be varified by the availability of reference and the type of platform.

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目	Exome Sequencing
使用機種	Novaseq 6000
対象生物	ヒト、マウス等
データ量	7～18Gb
リード長	150bp
ライブラリ作製	SureSelect V6（Human）または SureSelect Mouse
シーケンス方法	Paired End / Multiplex
必要サンプル量	gDNA 0.5μg以上
データ解析	Variant Calling（SNP、In/Del） Annotation
価格（税抜）	シーケンス費用（ライブラリ作製込み）：　マウス 7Gb：￥52,000/サンプル（1～9サンプル時）　ヒト 7Gb：￥46,000/サンプル（1～9サンプル時）　ヒト 9Gb：￥51,000/サンプル（1～9サンプル時）　ヒト 18Gb：￥69,000/サンプル（1～9サンプル時）データ解析（SNP）：￥16,000/サンプル
納期（QC合格後）	4～6週間
納品物	シーケンシング結果（fastq）リファレンスゲノムへのマッピング結果クオリティコントロール結果ターゲット領域におけるdepth（冗長度）のヒストグラム SNV解析結果シーケンシングdepth（冗長度）とCCDSエクソンのカバレッジ解析結果

関連サイト

メーカーサイト

※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。