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バルクRNA-seqデータ解析 ID: J02321

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KOTAIバイオテクノロジーズまたは他施設で取得されたバルクRNAシーケンスデータを用いて、データ解析を行います

カテゴリ

サービスについて

概要

実施内容	メニュー詳細
シーケンスからデータ解析まで	こちらのページをご参照ください。シーケンスから標準的なデータ解析まで含むプランのご紹介です。（データ解析の内容は下記の「データ解析のみ」の場合と同様です。）
データ解析のみ（解析対象のFASTQファイルがすでに存在する場合）	下記のサービス内容をご参照ください。

［サービス内容］

FASTQファイルをお送りいただきます
サンプル情報や比較解析内容詳細をご提示いただきます
標準解析内容（概要）
・データQC・リファレンスゲノムへのマッピング・定量化
・次元削減
・クラスタリング（サンプル間のhierarchical clusteringや相関解析）
・変動遺伝子解析
・Enrichment解析（ヒト・マウスのみ）

上記の解析内容は、生物種・サンプル・データの詳細によって一部実施されない場合があります。

解析パイプラインは随時更新しておりますので、詳細はお問合せください。上記の標準解析メニュー以外でもカスタム解析を実施できる場合があります。
また、実施可能な解析内容は生物種やデータの詳細に依存する場合がありますので、事前にお気軽にご相談ください。

解析例（fig.1）（fig.2）（fig.3）（fig.4）

fig.1 変動遺伝子解析結果（Volcanoプロット）

fig.2 変動遺伝子解析結果（ヒストグラム）

fig.3 クラスタリング結果

fig.4 Enrichment解析結果

納品物

BAMとBAMインデックスファイル
サンプル毎の各遺伝子の発現量raw counts（csvファイル）
サンプル毎の各遺伝子のTPM-normalized counts（csvファイ）
Gene ID, chromosome上の遺伝子の位置情報、raw counts, TPM-normalized countsがまとまった表（csvファイル）
次元削減結果（PCA/MDSプロット、csvデータファイル）
クラスタリング解析結果（相関プロット、Dendrogram、csvデータファイル）
変動遺伝子解析結果（＊）（MAプロット、Volcanoプロット、ヒートマップ、csvデータファイル）
Enrichment解析結果（＊）（GO解析：プロットとcsvデータファイル、Reactome/Hallmark解析：プロットとcsvデータファイル）

（＊）サンプル数や解析結果により納品されない可能性のある図表を示しています。

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

実施内容	金額	納期
データ解析のみ（生物種がヒト・マウスの場合）	1サンプル：￥5,000 実験からご依頼の場合は無償	2週間
ヒト・マウス以外の生物種のリファレンス対応	1生物種：￥50,000	リファレンスデータの確認やお客様とのご相談に追加日数がかかる場合があります。

＊比較パターン数などによって追加費用がかかる場合があります。お問い合わせください。

受託オンラインCommissioned Research Online和研薬株式会社 和研薬株式会社

バルクRNA-seqデータ解析 ID: J02321

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解析例（fig.1）（fig.2）（fig.3）（fig.4）

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