概要
本サービスは、フローインジェクション法により正確な質量と高分解能な質量分析を実現した超ハイスループットの非標識メタボロミクスです。複雑な生物学的マトリックスにおける代謝物を同定し、短時間なデータ取得と効率的なパイプラインを組み合わせることで、他のメタボロミクスのアプローチよりもサンプルスループットを 30倍向上させることが可能です。そのため、1,000サンプルを超える大規模なコホートの分析も短時間にデータ取得することが可能です。
フローインジェクション質量分析: ポンプによって連続的にイオン源に送液されている溶媒にインジェクターなどを用いて試料溶液を注入し、カラム等を用いたクロマトグラフィーは行わない状態で試料溶液をイオン源に導入して行う質量分析法。
サービス内容
本サービスは、対象を絞らず非標的に広範な極性代謝物を検出し、同定する非標的メタボロミクスです。この代謝物プロファイリング法は全ての主要な代謝経路(アミノ酸代謝、エネルギー代謝、脂質代謝、ステロイド代謝、脂肪酸、アミノ糖および N-グリカン、ビタミンおよび補因子、イノシトールリン酸代謝)の代謝分子に加え、2-ヒドロキシグルタル酸やイタコン酸など代謝経路に通常割り当てられていないが、重要とされる代謝物もカバーしています。
カバレッジの一例として、血漿サンプルにおける解析では、心血管疾患、炎症、がんなどにおいて確立されているマーカーを含め1,200種類程度の代謝物のアノテーションが付けられます。
【成果物について】
本サービスは、サンプルの前処理、品質チェック、FIA-QTOF-MS 分析からデータ視覚化までを全て実施するトータルサービスです。
ご要望の分析内容により取得するデータは変更される場合がございますが、以下の様な各種解析結果をご提供させていただきます。
- プロジェクトレポート(html 形式):
サンプルQC、差分比較および統計(コホート / 比較情報が提供されている場合)
- 各種データファイル(xlsx 形式):
実験概要、完全なデータマトリックス(精選されたデータ)、差分統計(コホート / 比較情報が提供されている場合)
*MS1スペクトルの機器取得(Raw)ファイルは、ご要望に応じてご提供いたします。
- メタボロミクスデータ用のインタラクティブなオンライン環境(ソフトウェア):
ボルケーノプロット生成、差分特性の強度プロット、パスウェイマッピングとパスウェイエンリッチメント、超ハイスループットデータに適した順序分析と回帰分析。
サンプル条件
解析に必要なサンプル量の目安です。ご提供頂くサンプルによって、解析に必要なサンプル量や条件が異なります。詳しくは、お問合せください。
なお、メタボローム解析用のサンプルは、できるたけ新鮮なサンプルをご準備頂くことを推奨いたします。また、代謝化合物の中には、揮発性の性質を持つ化合物もありますので、基本的に凍結乾燥サンプル等は推奨しておりません。また、代謝分子の安定性を保つため、4℃以上での保管は避けてください。サンプル採取後、-80℃で保存し、凍結・融解を繰り返すことはできるだけ避けてください。
| サンプルタイプ |
推奨量(目安) |
| 血清・血漿 |
50μL以上 |
| 細胞 |
20万個(2x105 cells)以上 |
| 組織 |
20~50mg *組織部位により、必要量が変わる場合があります。 |
| その他 |
別途ご相談ください。 |
解析サンプルにつきましては、測定プラットフォームを一部自動化している関係上、以下の指定の 96well プレートおよびプレートシールを必ず使用してご送付ください。指定品以外のプレートなどの場合は、対応できない可能性があります。
| 血清および血漿サンプル |
・96well プレート:AbgeneTM 96Well 0.8mL Polypropylene Deepwell Storage Plate(Cat.# AB0859)
・プレートシール:NuncTM Seals,Tapes,and Foils(Cat.# 232698) |
その他、一般的なサンプルタイプ (抽出代謝物、組織、細胞など) |
・Thermo ScientificTM Matrix 0.5mL ScrewTop Tubes in Barcoded Latch Racks(Cat.# 3744-BR) |
本解析の96well プレートでのご準備方法については、こちらをご確認ください。
これら以外でも、以下の指定品でご準備頂ければ、1.5mL マイクロチューブでのご提出も可能です。ただし、マイクロチューブでご提出頂く場合は、取り扱いおよび作業手数料として、サンプルあたり¥3,000(税抜)の追加費用が発生いたしますので、ご注意ください。
利用可能なマイクロチューブ:Invitrogen RNase-free Microfuge Tubes(Cat.# AM12400)
*上記以外の容器類をご使用される場合は、必ず事前にご相談ください。