日本ジェネティクス / 日本ジェネティクス ID: J01669

small RNA-Seq解析 ID: J01669

サービスについて

サービス仕様

  • シーケンシング:illumina NovaSeq 6000 / SE50
  • 納品データ:fastqファイル形式
  • 納品方法:データダウンロード(100Gb未満)

ライブラリー調製方法

NEBNext® Multiplex
 Small RNA Library Prep Kit for Illumina®にてライブラリー調製をします。

データ解析(オプション)

標準データ解析(リファレンスあり) クリーンデータ
クリーンデータ(CatNo. NV-CLEAN)をご依頼いただくと、以下の作業を行います。

1)オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2)低質リード(Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード)の除去。
* Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3)塩基配列不明(N)が10%を超えるリードの除去。

*クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
*クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

サンプル要件

  • RNA量:2µg以上(total RNA)
  • 濃度:50ng/µL以上
  • 液量:10µL以上
  • RIN値:7.5以上
    *植物、細菌の場合は7.0以上
  • 純度:OD260/280 = 2.0以上、OD260/230 = 2.0以上、RNAの分解、DNAのコンタミがないこと。
* 本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
  記載のサンプル量の2倍の量が、推奨量となります。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
small RNA-Seq解析 お問い合わせ サンプルQC合格後20~22営業日

関連サイト