次世代シーケンサーを用いて遺伝子発現変動を網羅的に解析します。
| No | ライブラリー作製キット | RNA精製 方法 |
FFPE由来 RNA対応 |
特徴 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | TruSeq Stranded mRNA Library Prep（＊1） | poly A RNA精製 | × | ・最もスタンダードな手法。 ・分解の見られるRNAは適さない。 |
| 2 | TruSeq RNA Exome（＊2） | － | 〇 | ・ヒト遺伝子（21,415）のコーディング領域のみを濃縮して解析。 ・分解の見られるRNAでも解析可能。 |
| 3 | TruSeq Stranded Total RNA Library Prep | rRNA除去 | × | ・polyAを持たないタイプのnon-coding RNAもシーケンス可能。 ・分解の見られるRNAでも解析可能。 |
| 4 | SureSelect XT RNA direct, SureSelect Mouse All Exon（＊3） | － | 〇 | ・マウス遺伝子のコーディング領域のみを濃縮して解析。 ・分解の見られるRNAでも解析可能。 |
| ライブラリ作製キット | TruSeq Stranded mRNA Library Prep |
|---|---|
| 機種 | NovaSeq 6000 |
| 平均データ量 / サンプル | 約40Mリード以上 |
| シーケンス方法 | Paired End / Multiplex |
| バイオインフォマティクス解析 | スプライシングパターン予測、正規化された発現レベルの算出 発現レベルのサンプル間比較、GO解析 |
| 納期 | 品質評価通過後、約2.5ヶ月（＊） |
＊ 同時に解析を行うサンプル数が多い場合には、別途お打ち合わせの上決定いたします。
● ヒト、マウス、ラット以外の生物種の解析をご希望の場合は別途ご相談ください。
| ライブラリ作製キット | TruSeq Stranded mRNA Library Prep、 TruSeq Stranded Total RNA Library Prep |
TruSeq RNA Exome SureSelect XT RNA direct + SureSelect Mouse All Exon |
サンプルの種類 | 精製Total RNA | 精製Total RNA |
|---|---|---|
| RNA量 | 3μg | 0.5μg |
| 濃度（＊1） | 65ng/μL以上 | 20ng/μL以上 |
| RIN値（＊2） | 7以上 | -（＊3） |
＊1 サンプルの定量はAgilent 2100バイオアナライザまたはAgilent 2200 TapeStationを用いた方法を推奨しております。
＊2 サンプルの（バイオアナライザによる）電気泳動図がお手元にある場合にはご提供をお願いします。
＊3 200nt以上のRNA断片が50%以上（DV200≥50％）の品質を推奨しています。
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| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
|---|---|---|
| Transcriptome Sequencing | お問い合わせ | お問い合わせ |
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