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PrimeTime^® リアルタイムPCR用プローブ合成サービス ID: J01135

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ハイブリダイゼーション法（プローブ法、5’ Nuclease Assay法）を比較的安価に行う事が可能です。

カテゴリ

サービスについて

概要

PrimeTime^® 製品を用いることで今まで高価だったリアルタイムPCR -ハイブリダイゼーション法（プローブ法、5’ Nuclease Assay法）を比較的安価に行う事ができます。
インターカレーション法と異なり特異性が高いため、融解曲線を描いたり、PCR後のサンプルを電気泳動する必要もありません。遺伝子発現解析において、最も確実な手法です。

現在行なっている発現解析との比較検討のために、PrimeTime^® 製品の初回発注お試し無償サンプル提供も可能です。

PrimeTime^® では、下記情報が一つでも決まっていれば、必要なプライマー及びプローブを合成する事が出来ます。

お客様の合成したい配列
発現を見たい遺伝子
発現を見たいターゲット領域の配列
確認したいSNPs （4.LNA probe）

PrimeTime^® 5’ Nuclease Assayの原理（fig.1）

プライマーとプローブは、配列依存的にDNA配列に相補結合します。
この状態ではプローブは分解されていないため、蛍光色素とクエンチャーは接近して存在しています。
蛍光色素から発せられる蛍光は、クエンチャーに吸収されています。
ポリメラーゼがプライマーから伸長し、DNA合成が開始されます。
ポリメラーゼがプローブのところに来ると、エキソヌクレアーゼ活性により、相補結合しているプローブを分解します。
プローブが分解されると、蛍光色素はクエンチャーから離れます。
クエンチャーとの距離が大きくなるため、クエンチャーによる吸光が制限され、蛍光がリアルタイムPCR装置によって検出されるようになります。

fig.1 PrimeTime® 5’ Nuclease Assayの原理

合成サービス一覧

PrimeTime^® qPCR Assays
フォワードプライマー（以下 Fwプライマー）、リバースプライマー（以下 Rvプライマー）、プローブの3点を1つのチューブに入れて納品します。

納品形態：Primer2本＋Probe1本を、1本のチューブに入れて納品
精製グレード：Probe - HPLC精製、Primer - 脱塩
納期：5～10営業日

◆プレデザイン
ヒト・マウス・ラットについては、IDTでプレデザインしたアッセイを簡単に検索・ご購入いただけます。（アッセイ検索が可能です。）
Accession NO（Refseq Database NO）や遺伝子名だけでご購入いただけます。ご発注時には配列を開示しておりませんが、納品時には同封されるデータシートに3本のプライマー・プローブの配列情報が記載されています。

◆カスタム
プローブ、プライマー2本の配列をそれぞれ入力してください。

色素・価格表 >

5’レポータ色素/発光波長（nm）	3’クエンチャー	合成スケール
5’レポータ色素/発光波長（nm）	3’クエンチャー	Mini（100-rxn）	標準（500-rxn）	XL(2,500-rxn）
ATTO 425 483	ZEN / Iowa Black^TMFQ	お問い合わせ	お問い合わせ	お問い合わせ
FAM 520	ZEN / Iowa BlackFQ
	Black HoleQuencher 1
	TAMRA
TET 539	ZEN / Iowa Black FQ
YAK 551	ZEN / Iowa Black^TM FQ
SUN 554	ZEN / Iowa Black^TM FQ
SUN 554	Iowa Black FQ
HEX 555	ZEN / Iowa Black^TM FQ
HEX 555	Black Hole Quencher 1
5’ Texas Red^®-X 617	Iowa Black RQ
5’ Texas Red^®-X 617	Black Hole Quencher 2
Cy5 668	Iowa Black RQ
	TAO / Iowa Black RQ
	Black Hole Quencher 2
ATTO 647 662	Iowa Black RQ
ATTO 647 662	Black Hole Quencher 2
Cy5.5 706	Black Hole Quencher 3

・Primerの量は、Standardの場合2.5～10nmolの範囲で、XLの場合12.5～50nmoleの範囲で指定可能です。
＊例えばddPCRでは、プライマー:プローブ=4:1をお勧めしています。なお、Miniスケールでは、Probe / Primer量は変更できません。
・Probeの長さは、15～35basesです。それ以外の長さは、お問合せ下さい。
＊ IBFQ: Iowa Black^® FQ, IBRQ: Iowa Black^® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher^® 1, BHQ2: Black Hole Quencher^® 2
>> クエンチャーについて

PrimeTime^® qPCR Probes

納品形態：Probeのみ納品
精製グレード：HPLC精製
納期：5～10営業日

5’レポーター色素 / 発光波長（nm)	クエンチャー	最低収量保証
5’レポーター色素 / 発光波長（nm)	クエンチャー	15nmol	25nmol	50nmol
FAM 520	ZEN / Iowa Black^TM FQ	お問い合わせ	お問い合わせ	お問い合わせ

5’レポーター色素 / 発光波長（nm)	クエンチャー	合成スケール / 最低保証
5’レポーター色素 / 発光波長（nm)	クエンチャー	100nmol / 10nmol	250nmol / 25nmol	1μmol / 50nmol
FAM 520	TAMRA	お問い合わせ	お問い合わせ	お問い合わせ
FAM 520	Black Hole Quencher 1
TET 539	ZEN / Iowa Black^TM FQ
TET 539	Black Hole Quencher 1
YAK 549	ZEN / Iowa Black^TM FQ
SUN 554	ZEN / Iowa Black^TM FQ
SUN 554	owa Black FQ
HEX 555	ZEN / Iowa Black^TM FQ
HEX 555	Black Hole Quencher 1

5’レポーター色素 / 発光波長（nm)	クエンチャー	最低収量保証
5’レポーター色素 / 発光波長（nm)	クエンチャー	2nmol	8nmol	20nmol
FAX 520	TAMRA NHSエステル	お問い合わせ	お問い合わせ	お問い合わせ
JOE NHSエステル 555	ZEN / IBFQ
JOE NHSエステル 555	BHQ1
MAX NHS 556	ZEN / IBFQ
MAX NHS 556	BHQ1
TYE563 563	IBRQ
TYE563 563	BHQ2
Cy3 564	IBRQ
Cy3 564	BHQ2
TAMRA NHSエステル 583	IBRQ
TAMRA NHSエステル 583	BHQ2
ROX 608	BHQ2
ROX 608	IBRQ
TEX615 613	IBRQ
TEX615 613	BHQ2
Texas Red-X NHSエステル 617	IBRQ
Texas Red-X NHSエステル 617	BHQ2
TYE665 665	IBRQ
TYE665 665	BHQ2
Cy5 668	IBRQ
	BHQ2
	TAO / IBRQ

・Probeの長さは、15～35basesです。それ以外の長さは、お問合せ下さい。
＊ IBFQ: Iowa Black^® FQ, IBRQ: Iowa Black^® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher^® 1, BHQ2: Black Hole Quencher^® 2
>> クエンチャーについて

PrimeTime^® qPCR primers
インターカレーター法での検出用です。Fwプライマー、Rvプライマーのみを1つのチューブに入れて納品します。

納品形態：Primer2本を1本のチューブに入れて納品
精製グレード：脱塩
納期：5～10営業日

プローブを必要としない、インターカレーター法用のプライマーです。プレデザインされたアッセイを検索できるため、ご自身でプライマーの設計を行う必要がありません。そのため、非常に簡便に特定遺伝子に対するプライマーをご注文頂けます。（アッセイ検索はヒト・マウス・ラットに対してのみ可能です。）

価格（税抜） Primer 納品量反応回数

お問い合わせ 5nmole 500回（20μL反応系）

納品されるPrimerは、同じID番号のPrimeTime^® qPCR Assayの2本のPrimerと同じ配列です。

価格（税抜）	Primer 納品量	反応回数
お問い合わせ	5nmole	500回（20μL反応系）

Affinity Plus qPCR Probes
Affinity Plus qPCR プローブは、FFPE組織やリキッドバイオプシーなどの、検出が難しいターゲットや、トランスクリプトバリアントなどのSNPジェノタイピングに有益です。
Affinity Plus qPCR プローブは最大6個までの Locked Nucleic Acid (LNA)塩基を含みます。LNAはDNA塩基と比較して安定であるため、プローブにこのLNA塩基を用いると、ハイブリダイゼーション時のTm値が向上します。
LNAを用いることで、下記が期待できます。

・一般的なqPCRと比較して、ミスマッチの識別能が向上します。
・アッセイにおけるハイブリダイゼーションの特異性を高める簡単なアプローチです。
・MGB修飾よりも簡単にTm値を調整できます。

詳しくはこちらをご覧ください。

5’レポーター色素	クエンチャー	納品量	価格（税抜）	納期
FAX	Iowa Black^TM FQ	0.5nmol	お問い合わせ	約2週間
YAK	Iowa Black^TM FQ
SUN	Iowa Black^TM FQ
HEX	Iowa Black^TM FQ
Cy5	Iowa Black^TM FQ

＊ IBFQ: Iowa Black^® FQ, IBRQ: Iowa Black^® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher^® 1, BHQ2: Black Hole Quencher^® 2
>> クエンチャーについて

［Affinity Plus qPCR Probes 価格］

5’レポーター色素	クエンチャー	合成スケール	最低保証	価格（税抜）
5’6-FAM	3’ Black Hole Quencher^® 1	250nmol	8nmol	お問い合わせ
	3’ Black Hole Quencher^® 1	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM FQ	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM FQ	1μmol	20
5’ Cy^®3	3’ Black Hole Quencher^® 2	250nmol	8
	3’ Black Hole Quencher^® 2	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	1μmol	20
5’SUN^TM	3’ Iowa Black^TM FQ	250nmol	8
5’SUN^TM	3’ Iowa Black^TM FQ	1μmol	20
5’ Cy^®5^TM	3’ Black Hole Quencher^® 2	250nmol	8
	3’ Black Hole Quencher^® 2	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	1μmol	20
5’ TEX 615^TM	3’ Black Hole Quencher^® 2	250nmol	8
	3’ Black Hole Quencher^® 2	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	1μmol	20
5’ TYE^TM 563	3’ Black Hole Quencher^® 2	250nmol	8
	3’ Black Hole Quencher^® 2	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	1μmol	20
5’ TYE^TM 665	3’ Black Hole Quencher^® 2	250nmol	8
	3’ Black Hole Quencher^® 2	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM RQ-Sp	1μmol	20
5’ HEX	3’ Black Hole Quencher^® 1	250nmol	8
	3’ Black Hole Quencher^® 1	1μmol	20
	3’ Iowa Black^TM FQ	250nmol	8
	3’ Iowa Black^TM FQ	1μmol	20
5’ Yakima Yellow^®	3’ Iowa Black^TM FQ	250nmol	8
5’ Yakima Yellow^®	3’ Iowa Black^TM FQ	1μmol	20

PrimeTime^® Gene Expression Master Mix
プローブ法用のマスターミックスで、PrimeTimeはもちろん、他社様のプローブでもご使用頂けます。

詳しくはこちらをご覧ください。

特長

ダブルクエンチャー（fig.2）
IDTでは、よりシグナルを増幅させ、またバックグラウンドを軽減させる「ダブルクエンチャーシステム」を採用しています。
これまでは、5’末端と3’末端に蛍光色素とクエンチャーを用いる事が一般的でしたが、ダブルクエンチャーシステムでは、5’末端から9塩基と10塩基の間にZENやTAOというクエンチャーを付加しています。
これにより、プローブの消光作用がより大きくなるため、顕著にバックグラウンドが軽減します。また、プローブが長くなりがちなAT-rich領域へのプローブ作製も容易になりました。
>>さらに詳しく

fig.2 ダブルクエンチャー

Mini合成スケール
IDTでは、ご利用頂きやすい小さなスケールで合成を行っております。
5’FAM / ZEN / 3’IBFQ 100回分（20μL反応系）プローブ、アッセイをお求め頂け、大変安価にプローブ法で実験を行う事ができます。
プレデザイン
ヒト・マウス・ラットでは、遺伝子ごとに配列をプレデザインしたアッセイを簡単に検索・ご購入いただけます。（アッセイ検索が可能です。）
そのため、Accession NOのみで注文が可能です。
受注時に配列開示はしておりませんが、納品時には同封されるデータシートに3本のプライマー・プローブの配列情報が記載されています。

PO Num. の入力方法は、こちらをご参照下さい。

PrimeTime の選択手順（fig.3）

fig.3 PrimeTime の選択手順

ご注文に関して

以下のファイルをご利用の上、お問い合わせフォームからご送付ください。

専用注文書類

見積依頼フォーム（General Order form） (Excel)

参考価格・納期

サービス項目	価格（税抜）	納期
PrimeTime^® リアルタイムPCR用プローブ合成サービス	お問い合わせ	お問い合わせ

受託オンラインCommissioned Research Online和研薬株式会社 和研薬株式会社

PrimeTime^® リアルタイムPCR用プローブ合成サービス ID: J01135

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