Ella Biotech / フィルジェン ID: J01016

トリマーオリゴを用いたランダムオリゴヌクレオチドライブラリー合成 ID: J01016

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トリヌクレオチドを用いたランダムオリゴヌクレオチドライブラリーを販売しています。カスタム合成も対応可能です。

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サービスについて

概要

ライブラリー構築に 2’-デオキシヌクレオチドトリマーホスホロアミダイト（トリマーオリゴヌクレオチド）を使用しています。これは、オリゴヌクレオチド指向性突然変異誘発（oligonucleotide-directed mutagenesis、ODM）を行うために特に効率的な方法です。
本ライブラリー合成では、ランダム化部分をトリマーオリゴヌクレオチド（コドン）単位の混合物を用いて化学合成を行います。混合物に含まれる20種類のアミノ酸をコードするコドンは、終止コドンを避けた各1種類の配列をもつコドンを採用しており（利用可能なコドンの項を参照）、任意のアミノ酸を選択する、アミノ酸の比率を等しくする、任意のアミノ酸比率にするなどのことが可能です。

システインを除く(＊) 19種のアミノ酸をカバーするトリマーオリゴヌクレオチドの等モル量混合物をはじめ、含まれるトリマーオリゴヌクレオチドを個別に指定した混合物、ミックス比率を指定した混合物など研究者のニーズにきめ細やかに対応したトリマーオリゴヌクレオチド混合物での対応が可能です。

＊システインは、ジスルフィド結合による架橋を形成し、複雑化の原因となるため、取り除くことを推奨しています。（要望により、システイン含有混合物の合成も可能です。）

fig.1 ATC-Trimer

特長

コドンバイアス、フレームシフトが生じない
終止コドンが生成されない
合成スケール 40nmol、保証収量 3～5nmol
各トリマー存在比の分散値2～9％を保証（統計数300クローン）
90～95％の純度を保証（4～8カップリングのトリマーを含む70merの場合）
精製にはHPLCとPAGEを使用
ライブラリー合成前にNGSによりトリマーオリゴの品質チェック済み
ISO9001に準拠
トリマーオリゴの修飾が可能（ビオチン、リン酸化、スペーサーなど）（オプション）
無料でトリマーオリゴの増幅プライマーを提供可能（注文時に希望をお知らせください）（オプション）

利用可能なコドン

No.	アミノ酸	コード(5’-3’)	No.	アミノ酸	コード(5’-3’)
フォワード（コーディング）コドン			リバース（ノンコーディング）コドン
1	Lys	AAA	1	Phe	GAA
2	Asn	AAC	2	Val	AAC
3	Thr	ACC	3	Asp	ATC
4	Ile	ATC	4	His	ATG
5	Met	ATG	5	Leu	CAG
6	Gln	CAG	6	Met	CAT
7	His	CAT	7	Arg	TCT
8	Pro	CCA	8	Gln	CTG
9	Arg	CGT	9	Ser	AGA
10	Leu	CTG	10	Thr	GGT
11	Glu	GAA	11	Asn	GTT
12	Asp	GAT	12	Ala	TGC
13	Ala	GCA	13	Pro	TGG
14	Gly	GGT	14	Glu	TTC
15	Val	GTT	15	isoleucine, rev.	GAT
16	Tyr	TAC	16	tryptophane, rev.	CCA
17	Ser	TCT	17	glycine, rev.	ACC
18	Cys	TGC	18	lysine, rev.	TTT
19	Trp	TGG	19	tyrosine, rev.	GTA
20	Phe	TTC	20	Cys	GCA

合成デザイン例（fig.2）

fig.2 合成デザイン例

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