メタゲノム&ウイルスゲノム解析ツール PaHuM

ID:K05131

次世代シークエンサーのショートリードデータから、シームレスなメタゲノム解析・ウイルスゲノム解析をWindows、Mac、LinuxOSマシン上で解析可能です

PaHuM

    専用のインストーラーにて各種オープンソースプログラムおよびデータベースのインストール・ダウンロードを自動で行い、専用プログラムを使用して解析を行う研究支援システムです。

  • シームレスなメタゲノム・ウイルスゲノム配列解析
    過去の研究論文を参考に、一連の解析パイプラインを構築しました。
    解読リードのトリミング、宿主由来配列の除去、生物種分類、ウイルスゲノムのde novoアセンブリ、相同性検索が一度に可能です。
    NGS解読リードをご準備頂き、解析リストを作成後にプログラムを起動することで、複数サンプルの解析が自動で実行できます。
    ウイルスゲノム解析では、バクテリオファージを除去したゲノム配列を回収できます。
  • 宿主由来のtranscriptome解析
    RNA-seqの解読データを用いた解析の場合、宿主由来のデータを用いてtranscriptome解析の基礎データを得ることが可能です。
  • 解析結果の概要をデータベース化
    解析後は、結果の概要をまとめた簡易的なデータベースを作成します。解析サンプルの確認・比較の際にご利用いただけます。

  • 【システム要件】
    最低スペック
    ・CPU:4core以上、メモリ:8GB以上、ディスク:500Gb以上
    ・Windows 11、macOS 12以上
    ・LinuxOSは、Ubuntu 22以上

仕様

シリーズ PaHuM 初回・アカデミック版1年間使用ライセンス
(ダウンロード版/CD-R版)
PaHuM 更新・アカデミック版1年間使用ライセンス
(ダウンロード版/CD-R版)
詳細 ・PC1台に本解析プログラムを導入頂きます。
・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。
*当製品は、アカデミア限定となります。
・初回版1年間使用ライセンスご利用後のライセンスです。
・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。
*当製品は、アカデミア限定となります。
希望小売価格
(税抜)
お問い合わせ
(CD-R版は、別途送料が追加されます。)
お問い合わせ
(CD-R版は、別途送料が追加されます。)
*アカデミック対象ユーザは下記の通りです。
1. 大学、高専、高校等教育機関
2. 各省庁が認定している研究機関、医療機関
3. 国立研究開発法人、独立行政法人、大学共同利用機関法人、公益財団法人、地方公営企業(地方公共団体が経営する企業)
4. 特定非営利活動法人などのNPO団体
対象外となる機関であっても、エンドユーザー様が教育機関と兼任している場合はEmailアドレスまたは在職を証明する内容を提出頂ければアカデミック版の対象となります。