細菌・ウイルス向け統合ゲノム比較解析ツール CAT-MG

関塚産業 / 関塚産業

ID:K05129

カタログ (PDF) 解析プログラム購入申込書 (Excel)

次世代シークエンサーのショートリードデータ・fastaデータ・gff3データから、シームレスな微生物ゲノムの比較解析をWindows、Mac、LinuxOSマシン上で解析可能です

CAT-MG

コアゲノム解析・分子系統解析
過去の研究論文を参考に、一連の解析パイプラインを構築しました。
マッピング解析、バリアントコール、コアゲノムsingle nucleotide variants（SNVs）系統解析、塩基置換箇所のアノテーション、組換え領域推定を行います。細菌などのハプロイドゲノム対応の解析モードです。
比較したいサンプルのNGS解読リードもしくはfasta配列データ、参照配列データ（gbkファイル）をご準備頂き、解析リストを作成後にプログラムを起動することで、一連の解析が自動で実行できます。
アライメントデータを用いた分子系統解析
マルチプルアライメント解析、variant call、塩基置換箇所のアノテーション、分子系統解析、組換え領域推定を行います。ウイルスゲノムや遺伝子配列対応の解析モードです。
比較したいサンプルのfasta配列データ、参照配列データ（gbkファイル）をご準備頂き、解析リストを作成後にプログラムを起動することで、一連の解析が自動で実行できます。
パンゲノム解析
保存された遺伝子やサンプル特有の遺伝子などの情報を抽出する解析モードです。コア遺伝子の分子系統解析も可能です。
比較したいサンプルのアノテーション済みのgff3データをご準備頂き、解析リストを作成後にプログラムを起動することで、一連の解析が自動で実行できます。

仕様

シリーズ	CAT-MG 初回・アカデミック版1年間使用ライセンス（ダウンロード版/CD-R版）	CAT-MG 更新・アカデミック版1年間使用ライセンス（ダウンロード版/CD-R版）
詳細	・PC1台に本解析プログラムを導入致します。・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。 *当製品は、アカデミア限定となります。	・初回版 1年間使用ライセンスご利用後のライセンスです。・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。 *当製品は、アカデミア限定となります。
希望小売価格（税抜）	お問い合わせ（CD-R版は、別途送料が追加されます。）	お問い合わせ（CD-R版は、別途送料が追加されます。）

*アカデミック対象ユーザは下記の通りです。
1. 大学、高専、高校等教育機関
2. 各省庁が認定している研究機関、医療機関
3. 国立研究開発法人、独立行政法人、大学共同利用機関法人、公益財団法人、地方公営企業（地方公共団体が経営する企業）
4. 特定非営利活動法人などのNPO団体
対象外となる機関であっても、エンドユーザー様が教育機関と兼任している場合はEmailアドレスまたは在職を証明する内容を提出頂ければアカデミック版の対象となります。

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※価格及び製品仕様は予告なく変更されることがあります。
※価格に消費税は含まれておりません。
※日本国内への販売に限らせていただきます。また、製品によっては、当社から直接販売ができない地域がございます。
※会社名及び製品名は各社の商標または登録商標です。
※製品の設置状況や付加機能を分かりやすく表現するため、製品に含まれない商品をあわせて掲載している場合があります。
※表示金額以外に運送費、荷造費、搬入・据付費、組立設置費などを別途加算させていただくことがございます。
※製品本来の使用目的に合わせてご利用ください。
※製品によっては理化学実験の専門的な知識を必要とするものがあります。

シリーズ	CAT-MG 初回・アカデミック版1年間使用ライセンス（ダウンロード版/CD-R版）	CAT-MG 更新・アカデミック版1年間使用ライセンス（ダウンロード版/CD-R版）
詳細	・PC1台に本解析プログラムを導入致します。・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。 *当製品は、アカデミア限定となります。	・初回版 1年間使用ライセンスご利用後のライセンスです。・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。 *当製品は、アカデミア限定となります。
希望小売価格（税抜）	お問い合わせ（CD-R版は、別途送料が追加されます。）	お問い合わせ（CD-R版は、別途送料が追加されます。）